memory leak au déploiement dans tomcat

[E. Bellouni]

Bonjour,

Je tente d'installer la version 2.3 de MDWeb sur un tomcat (6.0.35) installé en local avec la configuration par défaut, ainsi que la variable JAVA_OPT = "-Xmx1024M -XX:MaxPermSize=512M -Dfile.encoding=UTF-8".

Au déploiement du war de mdweb une erreur survient indiquant une fuite mémoire :

ATTENTION: MDweb caught a NamingException while attempting to get the name of th
e application from the JEE container. This can happen on JEE 5 platforms that do
 not handle JNDI lookups.
16 janv. 2012 13:56:03 org.mdweb.app.listener.DefaultServletContextListener setE
PSGDatabase
INFO: No MDWeb EPSG datasource available
INFO      [ConfigureListener] Initializing Mojarra (1.2_15-20100816-SNAPSHOT) fo
r context '/mdweb23'
GRAVE     [StandardContext] Error listenerStart
GRAVE     [StandardContext] Erreur de d├®marrage du contexte [/mdweb23] suite au
x erreurs pr├®c├®dentes
GRAVE     [WebappClassLoader] The web application [/mdweb23] created a ThreadLoc
al with key of type [com.sun.xml.bind.v2.ClassFactory$1] (value [com.sun.xml.bin
d.v2.ClassFactory$1@10ace8d]) and a value of type [java.util.WeakHashMap] (value
 [{class javax.xml.bind.annotation.W3CDomHandler=java.lang.ref.WeakReference@7e9
bed}]) but failed to remove it when the web application was stopped. This is ver
y likely to create a memory leak.

Suite à cette tentative de déploiement, le test "memory leak" de Tomcat répond :

The following web applications were stopped (reloaded, undeployed), but their
classes from previous runs are still loaded in memory, thus causing a memory
leak (use a profiler to confirm):
/mdweb23

Le redémarrage de tomcat n'y fait rien.

Avez vous une idée d'où peut provenir ce problème ?

Merci par avance.

[Mediii]

Bonjour,

Pour mieux vous répondre nous avons besoin des fichiers de logs complets, en particulier le localhost.log se trouvant dans tomcat/logs


Bien cordialement,

Mehdi,

Geomatys

[E. Bellouni]

Merci de m'avoir répondu.

Voici donc la log en question :

GRAVE: Exception lors de l'envoi de l'évènement contexte initialisé (context initialized) à l'instance de classe d'écoute (listener) org.mdweb.app.listener.DefaultServletContextListener
java.lang.NoClassDefFoundError: javax/media/jai/RegistryElementDescriptor
        at org.geotoolkit.internal.image.Setup.initialize(Setup.java:55)
        at org.geotoolkit.lang.Setup.initialize(Setup.java:207)
        at org.mdweb.app.listener.DefaultServletContextListener.contextInitialized(DefaultServletContextListener.java:55)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.listenerStart(StandardContext.java:4206)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.start(StandardContext.java:4705)
        at org.apache.catalina.core.ContainerBase.addChildInternal(ContainerBase.java:799)
        at org.apache.catalina.core.ContainerBase.addChild(ContainerBase.java:779)
        at org.apache.catalina.core.StandardHost.addChild(StandardHost.java:601)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.deployWAR(HostConfig.java:943)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.deployApps(HostConfig.java:563)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.check(HostConfig.java:1399)
        at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
        at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
        at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
        at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source)
        at org.apache.tomcat.util.modeler.BaseModelMBean.invoke(BaseModelMBean.java:297)
        at com.sun.jmx.interceptor.DefaultMBeanServerInterceptor.invoke(Unknown Source)
        at com.sun.jmx.mbeanserver.JmxMBeanServer.invoke(Unknown Source)
        at org.apache.catalina.manager.ManagerServlet.check(ManagerServlet.java:1500)
        at org.apache.catalina.manager.HTMLManagerServlet.doPost(HTMLManagerServlet.java:252)
        at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:637)
        at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:717)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:290)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:206)
        at org.apache.catalina.filters.CsrfPreventionFilter.doFilter(CsrfPreventionFilter.java:186)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:235)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:206)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:233)
        at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:191)
        at org.apache.catalina.authenticator.AuthenticatorBase.invoke(AuthenticatorBase.java:563)
        at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:127)
        at org.apache.catalina.valves.ErrorReportValve.invoke(ErrorReportValve.java:102)
        at org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke(StandardEngineValve.java:109)
        at org.apache.catalina.connector.CoyoteAdapter.service(CoyoteAdapter.java:293)
        at org.apache.coyote.http11.Http11AprProcessor.process(Http11AprProcessor.java:877)
        at org.apache.coyote.http11.Http11AprProtocol$Http11ConnectionHandler.process(Http11AprProtocol.java:594)
        at org.apache.tomcat.util.net.AprEndpoint$Worker.run(AprEndpoint.java:1675)
        at java.lang.Thread.run(Unknown Source)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: javax.media.jai.RegistryElementDescriptor
        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1680)
        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1526)
        ... 38 more
16 janv. 2012 13:56:05 org.apache.catalina.core.StandardContext listenerStop
GRAVE: Exception lors de l'envoi de l'évènement contexte détruit (context destroyed) à l'instance de classe d'écoute org.mdweb.app.listener.DefaultServletContextListener
java.lang.NoClassDefFoundError: javax/media/jai/JAI
        at org.geotoolkit.internal.image.Setup.shutdown(Setup.java:66)
        at org.geotoolkit.lang.Setup.shutdown(Setup.java:222)
        at org.mdweb.app.listener.DefaultServletContextListener.contextDestroyed(DefaultServletContextListener.java:74)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.listenerStop(StandardContext.java:4245)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.stop(StandardContext.java:4886)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.start(StandardContext.java:4750)
        at org.apache.catalina.core.ContainerBase.addChildInternal(ContainerBase.java:799)
        at org.apache.catalina.core.ContainerBase.addChild(ContainerBase.java:779)
        at org.apache.catalina.core.StandardHost.addChild(StandardHost.java:601)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.deployWAR(HostConfig.java:943)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.deployApps(HostConfig.java:563)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.check(HostConfig.java:1399)
        at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
        at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
        at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
        at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source)
        at org.apache.tomcat.util.modeler.BaseModelMBean.invoke(BaseModelMBean.java:297)
        at com.sun.jmx.interceptor.DefaultMBeanServerInterceptor.invoke(Unknown Source)
        at com.sun.jmx.mbeanserver.JmxMBeanServer.invoke(Unknown Source)
        at org.apache.catalina.manager.ManagerServlet.check(ManagerServlet.java:1500)
        at org.apache.catalina.manager.HTMLManagerServlet.doPost(HTMLManagerServlet.java:252)
        at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:637)
        at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:717)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:290)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:206)
        at org.apache.catalina.filters.CsrfPreventionFilter.doFilter(CsrfPreventionFilter.java:186)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:235)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:206)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:233)
        at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:191)
        at org.apache.catalina.authenticator.AuthenticatorBase.invoke(AuthenticatorBase.java:563)
        at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:127)
        at org.apache.catalina.valves.ErrorReportValve.invoke(ErrorReportValve.java:102)
        at org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke(StandardEngineValve.java:109)
        at org.apache.catalina.connector.CoyoteAdapter.service(CoyoteAdapter.java:293)
        at org.apache.coyote.http11.Http11AprProcessor.process(Http11AprProcessor.java:877)
        at org.apache.coyote.http11.Http11AprProtocol$Http11ConnectionHandler.process(Http11AprProtocol.java:594)
        at org.apache.tomcat.util.net.AprEndpoint$Worker.run(AprEndpoint.java:1675)
        at java.lang.Thread.run(Unknown Source)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: javax.media.jai.JAI
        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1680)
        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1526)
        ... 39 more

Il semblerait que JAI ne soit pas accessible, pourtant, dans mon C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_27\jre\lib\ext, j'ai les 3 jars suivants :
- jai_codec.jar
- jai_core.jar
- jai_imageio.jar

Voyez vous ce qui manque ?

[Guilhem Legal]

Bonjour,

L'installation de JAI et JAI-imageio semble incomplète, il manque les 2 jar suivant :
  - clibwrapper_jiio.jar
  - mlibwrapper_jai.jar

Verifier aussi que c'est la bonne jvm qui est utilisé par tomcat (il y a des log au lancement du startup.sh /.bat)

Guilhem Legal

[E. Bellouni]

Ok, problème résolu. J'ai concentré mes tests sur cette histoire de jars...

Bon, les 2 jars (clibwrapper_jiio et mlibwrapper_jai) étaient bien installés, j'avais juste oublié de les citer.

Par contre, il a fallu que je recopie les 5 jars JAI du répertoire "C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_27\jre\lib\ext" vers "C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_27\lib\ext".

Et ça a débloqué le problème. Il y a là-dedans une subtilité qui m'échappe...
Mais l'essentiel est que ça fonctionne.

Merci pour vos aiguillages !

[Thibault]

Bonjour,

Après avoir rajouter :
  - clibwrapper_jiio.jar
  - mlibwrapper_jai.jar

Dans le lib de tomcat, l'application fonctionne correctement.

Merci.